Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp1a4Q9WV27 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp1a4Q9WV27 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms