Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt3Q9QZ47 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms