Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ybx3Q9JKB3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms