Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtn3Q9ES97 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms