Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Capn12Q9ER56 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Capn12Q9ER56 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Capn12Q9ER56 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Capn12Q9ER56 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Capn12Q9ER56 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn12Q9ER56 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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