Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB54

Fam216a, Protein FAM216A, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam216aQ9DB54 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam216aQ9DB54 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam216aQ9DB54 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam216aQ9DB54 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam216aQ9DB54 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam216aQ9DB54 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam216aQ9DB54 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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