Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc89Q9DA73 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc89Q9DA73 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc89Q9DA73 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc89Q9DA73 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc89Q9DA73 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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