Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc83Q9D4V3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms