Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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