Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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