Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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