Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rprd1bQ9CSU0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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