Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CactinQ9CS00 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CactinQ9CS00 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms