Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pdzk1ip1Q9CQH0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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