Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms