Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms