Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp16Q99LG0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp16Q99LG0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms