Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Higd1bQ99JY6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms