Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nrif1Q923B3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nrif1Q923B3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Nrif1Q923B3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Nrif1Q923B3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nrif1Q923B3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Nrif1Q923B3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nrif1Q923B3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nrif1Q923B3 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nrif1Q923B3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nrif1Q923B3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Nrif1Q923B3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nrif1Q923B3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nrif1Q923B3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Nrif1Q923B3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms