Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubb6Q922F4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms