Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmx1Q8VBT0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmx1Q8VBT0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms