Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trpm6Q8CIR4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trpm6Q8CIR4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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