Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Ercc8Q8CFD5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ercc8Q8CFD5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ercc8Q8CFD5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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