Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Usp27Q8CEG8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp27Q8CEG8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp27Q8CEG8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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