Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg16l1Q8C0J2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Atg16l1Q8C0J2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atg16l1Q8C0J2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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