Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4aQ8BW72 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4aQ8BW72 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms