Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gga3Q8BMI3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms