Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmco3Q8BH01 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmco3Q8BH01 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms