Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo1Q7TT28 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo1Q7TT28 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms