Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms