Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CltbQ6IRU5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CltbQ6IRU5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms