Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnna3Q65CL1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnna3Q65CL1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms