Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctr9Q62018 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms