Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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PcolceQ61398 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PcolceQ61398 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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