Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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BcanQ61361 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BcanQ61361 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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