Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tsr1Q5SWD9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tsr1Q5SWD9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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