Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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