Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Palb2Q3U0P1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Palb2Q3U0P1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms