Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prr27Q3SYJ2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms