Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smrp1Q2MH31 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smrp1Q2MH31 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms