Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Traf3ip1Q149C2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms