Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Shisal1Q0VBP7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms