Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
StumQ0VBF8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms