Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a2Q07643 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a2Q07643 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a2Q07643 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Col9a2Q07643 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms