Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NfiaQ02780 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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NfiaQ02780 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NfiaQ02780 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NfiaQ02780 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NfiaQ02780 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfiaQ02780 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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