Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ctnnb1Q02248 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ctnnb1Q02248 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms