Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx3P81067 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx3P81067 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx3P81067 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms