Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CiitaP79621 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CiitaP79621 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms