Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf5P70191 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Traf5P70191 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Traf5P70191 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms