Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P58686 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P58686 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
P58686 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P58686 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
P58686 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
P58686 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms